Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nop58Q6DFW4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms