Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Itga3Q62470 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Itga3Q62470 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms