Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PcolceQ61398 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PcolceQ61398 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PcolceQ61398 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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