Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Laptm4aQ60961 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms