Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Traf3Q60803 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Traf3Q60803 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms