Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trdv2-2Q5R1A4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms