Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttf2Q5NC05 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ttf2Q5NC05 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms