Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Nlrc3Q5DU56 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nlrc3Q5DU56 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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