Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CenpjQ569L8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CenpjQ569L8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms