Protein–RNA interactions for Protein: Q3V009

Tmed1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed1Q3V009 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed1Q3V009 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed1Q3V009 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms