Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-Eb2Q3UUV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms