Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms