Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc10Q3TLI0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms