Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc69Q3TCJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms