Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ccbe1Q3MI99 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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