Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdgfl1Q2VPR5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl1Q2VPR5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 231.4 ms