Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd11Q1RNF8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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