Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cpne9Q1RLL3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne9Q1RLL3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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