Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Traf3ip1Q149C2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Traf3ip1Q149C2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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