Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Itgb8Q0VBD0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itgb8Q0VBD0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms