Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnn2Q08093 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnn2Q08093 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms