Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cab39Q06138 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cab39Q06138 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms