Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msx2Q03358 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms