Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Runx1Q03347 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Runx1Q03347 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms