Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gjb4Q02738 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms