Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snai1Q02085 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snai1Q02085 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms