Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EgfrQ01279 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EgfrQ01279 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms