Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Irx2P81066 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Irx2P81066 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms