Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cxcr4P70658 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms