Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lsm3P62311 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm3P62311 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms