Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx1bP61264 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.9 ms