Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aqp4P55088 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aqp4P55088 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms