Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cox8bP48772 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cox8bP48772 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms