Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VdrP48281 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VdrP48281 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VdrP48281 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VdrP48281 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms