Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx2P48031 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gbx2P48031 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms