Protein–RNA interactions for Protein: P43687

Hmx2, Homeobox protein HMX2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmx2P43687 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hmx2P43687 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hmx2P43687 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms