Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx2-5P42582 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkx2-5P42582 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkx2-5P42582 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms