Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly6fP35460 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms