Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab17P35292 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab17P35292 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms