Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Saa4P31532 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms