Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjc1P28229 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms