Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psmb9P28076 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psmb9P28076 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms