Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl3P27659 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rpl3P27659 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rpl3P27659 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpl3P27659 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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