Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P18528 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18528 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18528 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18528 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms