Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSPP15924 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSPP15924 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSPP15924 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSPP15924 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSPP15924 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSPP15924 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
DSPP15924 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DSPP15924 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms