Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dnmt1P13864 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dnmt1P13864 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms