Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nid1P10493 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nid1P10493 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms