Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JtbO88824 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JtbO88824 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
JtbO88824 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
JtbO88824 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
JtbO88824 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
JtbO88824 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
JtbO88824 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms