Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn3O88705 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hcn3O88705 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms