Protein–RNA interactions for Protein: O55242

Sigmar1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sigmar1O55242 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sigmar1O55242 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sigmar1O55242 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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